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| Registros recuperados : 16 | |
| 3. |  | CHAVES, J. da S.; BARAÚNA, A. C.; MOSQUEIRA, C. A.; GIANLUPPI, V.; SILVA, K. da; ZILLI, J. E. Identificação e ocorrência de nodulação em espécies nativas e introduzidas de estilosantes no Cerrado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 34., 2013, Florianópolis. Ciência do solo: para quê e para quem: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 5. | | SILVA, K. da; CHAVES, J. da S.; BARAÚNA, A. C.; MOSQUEIRA, C. A.; GIANLUPPI, V.; ZILLI, J. E. Caracterização fenotípica de bactérias fixadoras de nitrogênio isoladas de estilosantes (styloshantes spp.) Isoladas no Cerrado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 34., 2013, Florianópolis. Ciência do solo: para quê e para quem: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 6. | | CHAVES. J. da S.; SILVA, J. da P.; COFFY, R. M.; GIANLUPPI, V.; SILVA, da K; ZILLI, J. E. Eficiência simbiótica de bactérias fixadoras de nitrogênio isoladas de estilosantes In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. FertBio 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 7. | | CHAVES, J. da S.; SILVA, J. P. da; COFFY, R. M.; GIANLUPPI, V.; SILVA, K. da; ZILLI, J. E. Eficiência simbiótica de bactérias fixadoras de nitrogênio isoladas de estilosantes. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. FertBio 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 8. | | COFFY, R. M.; CHAVES, J. da S.; FARIAS, E. do N. C.; ZILLI, J. E.; SILVA, K. da. Eficiência simbiótica de bactérias fixadoras de nitrogênio em Simbiose com pau-rainha (centrolobuim paraense tul.). In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. FertBio 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 9. | | COFFY, R. M.; CHAVES, J. da S.; FARIAS, E. do N. C.; ZILLI, J. E.; SILVA, da K. Eficiência simbiótica de bactérias fixadoras de nitrogênio em simbiose com pau-rainha. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. FertBio 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 10. | | MOSQUEIRA, C. A.; CHAVES, J. da S.; SILVA, J. P. da; HUNGRIA, M.; SILVA, K. da; ZILLI, J. E. Eficiência da fixação de N2 em feijão-caupi inoculado com estirpes de rizóbio isolados de diferentes regiões de Roraima. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. FertBio 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 11. | | MOSQUEIRA, C. A.; CHAVES, J. da S.; SILVA, J. P. da; HUNGRIA, M.; SILVA, K. da; ZILLI, J. E. Eficiência da fixação de N2 em feijão-caupi inoculado com estirpes de rizóbio isolados de diferentes regiões de Roraima. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. FertBio 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 12. | | MOSQUEIRA, C. A.; CHAVES, J. da S.; SILVA, J. P. da; HUNGRIA, M.; ZILLI, J. E.; SILVA, K. da. Eficiência da fixação de N2 em feijão-caupi inoculado com estirpes de rizóbio isolados de diferentes regiões de Roraima. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: SBCS, 2014. FertBio 2014| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 15. | | SILVA, K. da; GIANLUPPI, V.; SMIDERLE, O. J.; ZILLI, J. E.; CHAVES, J. da S.; BARAÚNA, A. C.; MOSQUEIRA, C. A. Isolamento e Diversidade de Bactérias Fixadoras de Nitrogênio Obtidas de Diferentes Espécies de Estilosantes no Cerrado de Roraima. Boa Vista, RR: Embrapa Roraima, 2017. (Embrapa Roraima. Documentos, 62).| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Roraima. |
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| 16. | | PORTO, D. S.; FARIAS, E. do N. C.; CHAVES, J. da S.; SOUZA, B. F.; MEDEIROS, R. D. de; ZILLI, J. E.; SILVA, K. da. Symbiotic effectiveness of Bradyrhizobium ingae in promoting growth of Inga edulis Mart. seedlings. Revista Brasileira de Ciência do Solo, v. 41, Epub, 06 Fev. 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Roraima. |
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| Registros recuperados : 16 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
14/02/2023 |
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Data da última atualização: |
26/04/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
ROGÉRIO, F.; BARONCELLI, R.; CUEVAS-FERNÁNDEZ, F. B.; BECERRA, S.; CROUCH, J.; BETTIOL, W.; AZCÁRATE-PERIL, M. A.; MALAPI-WIGHT, M.; ORTEGA, V.; BETRAN, J.; TENUTA, A.; DAMBOLENA, J. S.; ESKER, P. D.; REVILLA, P.; JACKSON-ZIEMS; HILTBRUNNER, J.; MUNKVOLD, G.; BUHINICEK, I.; VICENTE-VILLARDÓN, J. L.''''; SUKNO, S. A.; THON, M. R. |
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Afiliação: |
FLÁVIA ROGÉRIO, UNIVERSIDAD DE SALAMANCA; RICCARDO BARONCELLI, UNIVERSITÀ DI BOLOGNA; FRANCISCO BORJA CUEVAS-FERNÁNDEZ, UNIVERSIDAD DE SALAMANCA; SIOLY BECERRA, UNIVERSIDAD DE SALAMANCA; JOANNE CROUCH, UNITED STATES DEPARTMENT OF AGRICULTURE; WAGNER BETTIOL, CNPMA; MARIA ANDREA AZCÁRATE-PERIL, UNIVERSITY OF NORTH CAROLINE; MARTHA MALAPI-WIGHT, UNITED STATES DEPARTMENT OF AGRICULTURE; VERONIQUE ORTEGA, SYNGENTA SEEDS; JAVIER BETRAN, BAYER CROP SCIENCE; ALBERT TENUTA, UNIVERSITY OF GUELPH-RIDGETOWN; JOSÉ S DAMBOLENA, UNIVERSIDAD NACIONAL DE CÓRDOBA; PAUL D ESKER, THE PENNSYLVANIA STATE UNIVERSITY; PEDRO REVILLA, CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTÍFICAS; TAMRA A JACKSON-ZIEMS, UNIVERSITY OF NEBRASKA-LINCOLN; JÜRG HILTBRUNNER, DÉPARTEMENT FÉDÉRAL DE L'ÉCONOMIE, DE LA FORMATION ET DE LA RECHERCHE; GARY MUNKVOLD, IOWA STATE UNIVERSITY; IVICA BUHINICEK, BC INSTITUTE FOR BREEDING AND PRODUCTION OF FIELD CROPS; JOSÉ LUIS VICENTE-VILLARDÓN, UNIVERSIDAD DE SALAMANCA; SERENELLA A SUKNO, UNIVERSIDAD DE SALAMANCA; MICHAEL R THON, UNIVERSIDAD DE SALAMANCA. |
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Título: |
Population genomics provide insights into the global genetic structure of Colletotrichum graminicola, the causal agent of maize anthracnose. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
MBio, v. 14, n. 1, e0287822, 2022. |
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ISSN: |
2150-7511 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1128/mbio.02878-22 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Understanding the genetic diversity and mechanisms underlying genetic variation in pathogen populations is crucial to the development of effective control strategies. We investigated the genetic diversity and reproductive biology of Colletotrichum graminicola isolates which infect maize by sequencing the genomes of 108 isolates collected from 14 countries using restriction site-associated DNA sequencing (RAD-seq) and whole-genome sequencing (WGS). Clustering analyses based on single-nucleotide polymorphisms revealed three genetic groups delimited by continental origin, compatible with short-dispersal of the pathogen and geographic subdivision. Intra- and intercontinental migration was observed between Europe and South America, likely associated with the movement of contaminated germplasm. Low clonality, evidence of genetic recombination, and high phenotypic diversity were detected. We show evidence that, although it is rare (possibly due to losses of sexual reproduction- and meiosis-associated genes) C. graminicola can undergo sexual recombination. Our results support the hypotheses that intra- and intercontinental pathogen migration and genetic recombination have great impacts on the C. graminicola population structure. Importance: Plant pathogens cause significant reductions in yield and crop quality and cause enormous economic losses worldwide. Reducing these losses provides an obvious strategy to increase food production without further degrading natural ecosystems; however, this requires knowledge of the biology and evolution of the pathogens in agroecosystems. We employed a population genomics approach to investigate the genetic diversity and reproductive biology of the maize anthracnose pathogen (Colletotrichum graminicola) in 14 countries. We found that the populations are correlated with their geographical origin and that migration between countries is ongoing, possibly caused by the movement of infected plant material. This result has direct implications for disease management because migration can cause the movement of more virulent and/or fungicide-resistant genotypes. We conclude that genetic recombination is frequent (in contrast to the traditional view of C. graminicola being mainly asexual), which strongly impacts control measures and breeding programs aimed at controlling this disease. MenosAbstract: Understanding the genetic diversity and mechanisms underlying genetic variation in pathogen populations is crucial to the development of effective control strategies. We investigated the genetic diversity and reproductive biology of Colletotrichum graminicola isolates which infect maize by sequencing the genomes of 108 isolates collected from 14 countries using restriction site-associated DNA sequencing (RAD-seq) and whole-genome sequencing (WGS). Clustering analyses based on single-nucleotide polymorphisms revealed three genetic groups delimited by continental origin, compatible with short-dispersal of the pathogen and geographic subdivision. Intra- and intercontinental migration was observed between Europe and South America, likely associated with the movement of contaminated germplasm. Low clonality, evidence of genetic recombination, and high phenotypic diversity were detected. We show evidence that, although it is rare (possibly due to losses of sexual reproduction- and meiosis-associated genes) C. graminicola can undergo sexual recombination. Our results support the hypotheses that intra- and intercontinental pathogen migration and genetic recombination have great impacts on the C. graminicola population structure. Importance: Plant pathogens cause significant reductions in yield and crop quality and cause enormous economic losses worldwide. Reducing these losses provides an obvious strategy to increase food production without further degrading natural ecosys... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Antracnose; Colletotrichum Graminicola; Milho; Variação Genética. |
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Thesaurus NAL: |
Anthracnose; Corn; Fungal diseases of plants; Genetic recombination; Genomics; Phylogeography; Population genetics. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/249422/1/Bettiol-Population-Genomics-2023.pdf
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Marc: |
LEADER 03830naa a2200517 a 4500
001 2151733
005 2023-04-26
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a2150-7511
024 7 $ahttps://doi.org/10.1128/mbio.02878-22$2DOI
100 1 $aROGÉRIO, F.
245 $aPopulation genomics provide insights into the global genetic structure of Colletotrichum graminicola, the causal agent of maize anthracnose.$h[electronic resource]
260 $c2022
520 $aAbstract: Understanding the genetic diversity and mechanisms underlying genetic variation in pathogen populations is crucial to the development of effective control strategies. We investigated the genetic diversity and reproductive biology of Colletotrichum graminicola isolates which infect maize by sequencing the genomes of 108 isolates collected from 14 countries using restriction site-associated DNA sequencing (RAD-seq) and whole-genome sequencing (WGS). Clustering analyses based on single-nucleotide polymorphisms revealed three genetic groups delimited by continental origin, compatible with short-dispersal of the pathogen and geographic subdivision. Intra- and intercontinental migration was observed between Europe and South America, likely associated with the movement of contaminated germplasm. Low clonality, evidence of genetic recombination, and high phenotypic diversity were detected. We show evidence that, although it is rare (possibly due to losses of sexual reproduction- and meiosis-associated genes) C. graminicola can undergo sexual recombination. Our results support the hypotheses that intra- and intercontinental pathogen migration and genetic recombination have great impacts on the C. graminicola population structure. Importance: Plant pathogens cause significant reductions in yield and crop quality and cause enormous economic losses worldwide. Reducing these losses provides an obvious strategy to increase food production without further degrading natural ecosystems; however, this requires knowledge of the biology and evolution of the pathogens in agroecosystems. We employed a population genomics approach to investigate the genetic diversity and reproductive biology of the maize anthracnose pathogen (Colletotrichum graminicola) in 14 countries. We found that the populations are correlated with their geographical origin and that migration between countries is ongoing, possibly caused by the movement of infected plant material. This result has direct implications for disease management because migration can cause the movement of more virulent and/or fungicide-resistant genotypes. We conclude that genetic recombination is frequent (in contrast to the traditional view of C. graminicola being mainly asexual), which strongly impacts control measures and breeding programs aimed at controlling this disease.
650 $aAnthracnose
650 $aCorn
650 $aFungal diseases of plants
650 $aGenetic recombination
650 $aGenomics
650 $aPhylogeography
650 $aPopulation genetics
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650 $aVariação Genética
700 1 $aBARONCELLI, R.
700 1 $aCUEVAS-FERNÁNDEZ, F. B.
700 1 $aBECERRA, S.
700 1 $aCROUCH, J.
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700 1 $aTENUTA, A.
700 1 $aDAMBOLENA, J. S.
700 1 $aESKER, P. D.
700 1 $aREVILLA, P.
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700 1 $aHILTBRUNNER, J.
700 1 $aMUNKVOLD, G.
700 1 $aBUHINICEK, I.
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700 1 $aSUKNO, S. A.
700 1 $aTHON, M. R.
773 $tMBio$gv. 14, n. 1, e0287822, 2022.
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Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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